NIST RM 8461人肝臟用于蛋白質(zhì)組學標準品旨在支持復雜樣品中肽和蛋白質(zhì)鑒定的研究,例如基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學中的那些。 RM 8461 可用于幫助評估實驗室內(nèi)肽和蛋白質(zhì)鑒定的可信度或?qū)嶒炇抑g或不同測量方法之間的可比性。 RM 8461 還可用于開發(fā)和驗證用于識別肽和蛋白質(zhì)的新研究方法。一個 RM 8461 單元由一個裝有約 0.5 克凍干人肝材料的小瓶組成。
儲存:
RM 8461 應儲存在受控的室溫(20 °C 至 25 °C)下,避免陽光直射,直至需要。
使用:
NIST RM 8461人肝臟用于蛋白質(zhì)組學標準品在取出測試部分進行分析之前,應*混合內(nèi)容物。建議使用等于或大于 1 mg 的分析測試部分。
分析:
對于蛋白質(zhì)特性等定性測量,不能使用符合 JCGM GUM 的測量不確定度的常規(guī)評估和表達。表 1 列出了使用鑒定算法建立的 1619 種蛋白質(zhì)的身份,其可靠性得到該領域?qū)<业钠毡檎J可。 RM 8461 中鑒定的蛋白質(zhì)是使用多個搜索引擎和多種樣品制備方法從自下而上的蛋白質(zhì)組學分析中推斷出來的。從 8 罐 RM 8461 的單個 1 mg 制劑 (n = 3) 中過濾出常見的蛋白質(zhì),并重復注射 (n = 3)。僅當滿足以下條件時才包含蛋白質(zhì):
• 錯誤發(fā)現(xiàn)率 (FDR) 低于 5 %,
• 整個測量組的光譜豐度優(yōu)于 20% CV(包括技術和工藝重復分析),
• 在RM 8461 的整個生產(chǎn)過程中,使用Sequest HT、Mascot、MSAmanda 和Byonic 算法從八個罐子的分層隨機抽樣中鑒定出至少三種*的肽。
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